Autoagrese - také známá jako autoalergie - je výsledkem obranné reakce těla proti antigenům vlastních buněk. Jinými slovy, tělo považuje své vlastní buňky a tkáně za nepřátelské a používá je k jejich ničení pomocí imunitního systému. Výsledkem jsou různá onemocnění. Listnatý pemfigus je nejčastějším onemocněním tohoto typu. Obvykle se objevuje mezi 3 a 5 lety a je charakterizována vezikulární kožní vyrážkou kolem očí, nosu a rtů. Vezikuly pak praskly do plochých vředů. Předisponované k této nemoci jsou mimo jiné akita, doberman, jezevčík, border kolie, newfoundland a labrador. Jeho variantou je pemphigus erythematodes, který způsobuje symetrické kožní změny na hlavě a uších, které se v létě zesilují. Poměrně často trpí němečtí a skotští ovčáci. Na oplátkupemphigus vulgaris se projevuje jako pustuly, puchýře a eroze v místech, kde kůže přechází do sliznice a v samotných membránách (např. v ústech, nosních dírkách, očních víčkách). Může dojít dokonce k zánětu a ztrátě drápů. Je to nevyléčitelná forma pemfigu. Jeho typem je houpací pemfigus s charakteristickými papilárními lézememi, které se transformují na strupy - nejčastěji na uších, někdy na trupu.
Fokální lupus erythematosus obvykle nevyvolává systémové příznaky, ale je omezen na kůži v ústech, která je červená a šupinatá. V létě se zintenzivňuje a pak dochází ke změně zabarvení nosního zrcátka, které praskne a křupá. Kolie jsou zvláště citlivé na lupus.
Voght-Koyanagi-Harada syndrom je charakterizován zabarvením kůže a vlasů a uveitidou (což může vést k oslepnutí). Nejčastěji se vyskytuje u psů Akita Inu, ale vyskytuje se také u Setters, Goldens, Samoyeds, Bernardines a Shetlanders.
Na druhé straně , eosinofilní syndrom se skládá z několika subjektů onemocnění, mezi něž patří: eosinofilní disku (na kůži břicha a stehen jsou pokryté žlutooranžové lézí), eosinofilní granulom (uzliny a vředy rozvíjet v ústech a zadních nohou) a eosinofilní vřed (kůže v místě léze). - nejčastěji na horním rtu - je vydutý, červený a vlhký).
Svalová slabost se vyskytuje zejména u španělů, foxteriérů a Jack Russell teriérů. Hlavním příznakem je slabost zvířete, únava rychle, nestabilní chůze, slabost zadních končetin, nalití jídla ihned po jídle.
Eozinofilní myositida se nejčastěji vyskytuje u německých ovčáků, rotvajlerů a dobermanů. Vyznačuje se zánětem masérských svalů - pes nemůže zavřít ani otevřít ústa. Diagnóza těchto stavů je založena na rozhovoru s majitelem domácího zvířete, klinických testech, krevních testech a alergických testech. Rozhodující je však histopatologické vyšetření. Léčba je dlouhá a často vyžaduje celoživotní léky.